本系位於校本部創研大樓4樓、5樓及6樓。 4樓包括元素分析實驗室、環境與營養流行病學實驗室；5樓包括社區醫學、衛生行政及健康行為科學研究室、公共衛生討論室Ⅱ；6樓包括環境分析實驗室、生物氣膠實驗室、分子生物實驗室、熱源區、藥品儲藏室、公共衛生討論室Ⅰ。
